Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BACE1P56817 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BACE1P56817 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BACE1P56817 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BACE1P56817 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BACE1P56817 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BACE1P56817 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BACE1P56817 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BACE1P56817 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BACE1P56817 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BACE1P56817 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BACE1P56817 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BACE1P56817 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BACE1P56817 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BACE1P56817 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BACE1P56817 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BACE1P56817 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BACE1P56817 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BACE1P56817 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BACE1P56817 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BACE1P56817 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BACE1P56817 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BACE1P56817 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BACE1P56817 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BACE1P56817 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BACE1P56817 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BACE1P56817 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BACE1P56817 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BACE1P56817 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
BACE1P56817 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BACE1P56817 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BACE1P56817 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BACE1P56817 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BACE1P56817 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BACE1P56817 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BACE1P56817 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BACE1P56817 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BACE1P56817 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BACE1P56817 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BACE1P56817 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BACE1P56817 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BACE1P56817 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BACE1P56817 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BACE1P56817 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BACE1P56817 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BACE1P56817 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BACE1P56817 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BACE1P56817 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BACE1P56817 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BACE1P56817 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BACE1P56817 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BACE1P56817 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BACE1P56817 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BACE1P56817 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BACE1P56817 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BACE1P56817 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BACE1P56817 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BACE1P56817 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BACE1P56817 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BACE1P56817 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BACE1P56817 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BACE1P56817 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BACE1P56817 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BACE1P56817 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BACE1P56817 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BACE1P56817 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BACE1P56817 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BACE1P56817 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BACE1P56817 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BACE1P56817 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BACE1P56817 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BACE1P56817 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BACE1P56817 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BACE1P56817 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BACE1P56817 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BACE1P56817 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BACE1P56817 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BACE1P56817 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BACE1P56817 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BACE1P56817 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BACE1P56817 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BACE1P56817 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BACE1P56817 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BACE1P56817 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BACE1P56817 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BACE1P56817 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BACE1P56817 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BACE1P56817 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BACE1P56817 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BACE1P56817 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BACE1P56817 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BACE1P56817 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BACE1P56817 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BACE1P56817 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BACE1P56817 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BACE1P56817 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
BACE1P56817 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BACE1P56817 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BACE1P56817 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
BACE1P56817 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms