Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAG2P55895 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAG2P55895 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAG2P55895 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAG2P55895 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAG2P55895 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAG2P55895 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAG2P55895 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAG2P55895 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAG2P55895 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAG2P55895 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAG2P55895 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAG2P55895 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAG2P55895 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAG2P55895 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAG2P55895 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAG2P55895 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAG2P55895 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAG2P55895 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAG2P55895 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAG2P55895 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAG2P55895 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAG2P55895 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAG2P55895 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAG2P55895 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAG2P55895 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAG2P55895 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAG2P55895 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAG2P55895 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAG2P55895 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAG2P55895 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAG2P55895 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAG2P55895 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAG2P55895 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAG2P55895 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAG2P55895 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAG2P55895 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAG2P55895 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAG2P55895 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAG2P55895 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAG2P55895 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAG2P55895 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAG2P55895 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAG2P55895 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAG2P55895 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAG2P55895 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAG2P55895 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAG2P55895 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAG2P55895 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAG2P55895 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAG2P55895 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAG2P55895 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAG2P55895 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAG2P55895 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAG2P55895 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAG2P55895 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAG2P55895 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAG2P55895 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAG2P55895 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAG2P55895 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAG2P55895 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAG2P55895 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAG2P55895 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAG2P55895 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAG2P55895 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAG2P55895 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAG2P55895 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAG2P55895 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAG2P55895 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAG2P55895 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAG2P55895 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAG2P55895 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAG2P55895 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAG2P55895 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAG2P55895 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAG2P55895 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAG2P55895 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAG2P55895 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAG2P55895 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAG2P55895 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAG2P55895 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAG2P55895 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAG2P55895 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAG2P55895 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAG2P55895 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAG2P55895 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAG2P55895 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAG2P55895 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAG2P55895 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAG2P55895 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAG2P55895 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAG2P55895 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAG2P55895 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAG2P55895 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAG2P55895 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAG2P55895 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAG2P55895 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAG2P55895 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RAG2P55895 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RAG2P55895 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms