Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RAD23AP54725 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms