Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CRISP1P54107 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CRISP1P54107 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms