Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
UBE2E1P51965 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E1P51965 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E1P51965 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E1P51965 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E1P51965 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E1P51965 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E1P51965 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E1P51965 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E1P51965 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E1P51965 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E1P51965 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E1P51965 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E1P51965 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E1P51965 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E1P51965 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E1P51965 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E1P51965 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E1P51965 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E1P51965 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E1P51965 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E1P51965 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E1P51965 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E1P51965 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E1P51965 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E1P51965 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
UBE2E1P51965 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E1P51965 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E1P51965 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E1P51965 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E1P51965 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E1P51965 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E1P51965 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E1P51965 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E1P51965 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E1P51965 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E1P51965 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E1P51965 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E1P51965 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E1P51965 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E1P51965 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E1P51965 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E1P51965 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E1P51965 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E1P51965 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E1P51965 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E1P51965 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E1P51965 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E1P51965 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E1P51965 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E1P51965 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E1P51965 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E1P51965 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E1P51965 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E1P51965 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E1P51965 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E1P51965 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
UBE2E1P51965 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E1P51965 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E1P51965 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E1P51965 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E1P51965 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E1P51965 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E1P51965 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E1P51965 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E1P51965 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E1P51965 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E1P51965 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E1P51965 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E1P51965 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
UBE2E1P51965 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms