Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RORCP51449 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RORCP51449 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RORCP51449 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RORCP51449 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RORCP51449 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RORCP51449 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RORCP51449 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RORCP51449 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RORCP51449 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RORCP51449 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RORCP51449 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RORCP51449 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RORCP51449 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RORCP51449 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RORCP51449 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RORCP51449 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RORCP51449 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RORCP51449 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RORCP51449 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RORCP51449 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RORCP51449 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RORCP51449 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RORCP51449 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RORCP51449 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RORCP51449 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RORCP51449 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RORCP51449 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RORCP51449 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RORCP51449 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RORCP51449 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RORCP51449 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RORCP51449 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RORCP51449 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RORCP51449 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RORCP51449 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RORCP51449 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RORCP51449 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RORCP51449 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RORCP51449 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RORCP51449 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RORCP51449 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RORCP51449 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RORCP51449 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RORCP51449 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RORCP51449 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RORCP51449 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RORCP51449 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RORCP51449 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RORCP51449 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RORCP51449 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RORCP51449 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RORCP51449 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RORCP51449 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RORCP51449 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RORCP51449 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RORCP51449 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RORCP51449 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RORCP51449 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RORCP51449 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RORCP51449 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RORCP51449 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RORCP51449 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RORCP51449 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RORCP51449 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RORCP51449 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RORCP51449 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RORCP51449 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RORCP51449 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RORCP51449 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RORCP51449 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RORCP51449 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RORCP51449 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RORCP51449 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RORCP51449 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RORCP51449 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RORCP51449 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RORCP51449 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RORCP51449 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RORCP51449 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RORCP51449 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RORCP51449 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RORCP51449 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RORCP51449 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RORCP51449 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RORCP51449 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RORCP51449 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RORCP51449 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RORCP51449 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RORCP51449 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RORCP51449 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RORCP51449 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RORCP51449 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RORCP51449 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RORCP51449 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RORCP51449 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RORCP51449 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RORCP51449 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RORCP51449 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RORCP51449 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms