Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP153P49790 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP153P49790 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP153P49790 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP153P49790 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP153P49790 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP153P49790 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP153P49790 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP153P49790 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NUP153P49790 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUP153P49790 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUP153P49790 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NUP153P49790 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUP153P49790 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUP153P49790 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NUP153P49790 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NUP153P49790 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUP153P49790 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUP153P49790 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUP153P49790 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUP153P49790 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUP153P49790 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUP153P49790 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUP153P49790 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUP153P49790 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUP153P49790 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NUP153P49790 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP153P49790 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP153P49790 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP153P49790 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP153P49790 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP153P49790 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP153P49790 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP153P49790 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP153P49790 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP153P49790 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP153P49790 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP153P49790 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP153P49790 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP153P49790 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP153P49790 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP153P49790 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP153P49790 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP153P49790 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP153P49790 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP153P49790 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP153P49790 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP153P49790 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP153P49790 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP153P49790 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP153P49790 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP153P49790 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NUP153P49790 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUP153P49790 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUP153P49790 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUP153P49790 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUP153P49790 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUP153P49790 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUP153P49790 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUP153P49790 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUP153P49790 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUP153P49790 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUP153P49790 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUP153P49790 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUP153P49790 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUP153P49790 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NUP153P49790 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP153P49790 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP153P49790 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP153P49790 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP153P49790 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP153P49790 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP153P49790 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP153P49790 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP153P49790 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP153P49790 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP153P49790 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP153P49790 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP153P49790 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP153P49790 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP153P49790 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP153P49790 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP153P49790 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP153P49790 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP153P49790 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP153P49790 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP153P49790 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NUP153P49790 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
NUP153P49790 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUP153P49790 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUP153P49790 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUP153P49790 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUP153P49790 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUP153P49790 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUP153P49790 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUP153P49790 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUP153P49790 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NUP153P49790 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NUP153P49790 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
NUP153P49790 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms