Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TNNI2P48788 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms