Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL1P40616 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL1P40616 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL1P40616 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL1P40616 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL1P40616 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL1P40616 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL1P40616 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL1P40616 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL1P40616 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL1P40616 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL1P40616 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL1P40616 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL1P40616 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL1P40616 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL1P40616 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL1P40616 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL1P40616 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL1P40616 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL1P40616 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL1P40616 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL1P40616 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL1P40616 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL1P40616 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL1P40616 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL1P40616 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL1P40616 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL1P40616 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ARL1P40616 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL1P40616 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL1P40616 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL1P40616 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL1P40616 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL1P40616 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL1P40616 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL1P40616 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL1P40616 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL1P40616 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL1P40616 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL1P40616 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL1P40616 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL1P40616 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL1P40616 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL1P40616 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL1P40616 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL1P40616 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL1P40616 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL1P40616 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL1P40616 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL1P40616 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL1P40616 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL1P40616 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL1P40616 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL1P40616 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL1P40616 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL1P40616 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL1P40616 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL1P40616 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL1P40616 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL1P40616 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL1P40616 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL1P40616 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ARL1P40616 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL1P40616 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL1P40616 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL1P40616 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL1P40616 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL1P40616 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL1P40616 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL1P40616 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL1P40616 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL1P40616 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL1P40616 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL1P40616 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL1P40616 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL1P40616 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL1P40616 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL1P40616 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL1P40616 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL1P40616 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL1P40616 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL1P40616 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL1P40616 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL1P40616 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL1P40616 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL1P40616 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ARL1P40616 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL1P40616 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL1P40616 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL1P40616 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL1P40616 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL1P40616 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL1P40616 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL1P40616 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL1P40616 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL1P40616 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL1P40616 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL1P40616 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL1P40616 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ARL1P40616 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms