Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ITGAEP38570 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ITGAEP38570 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms