Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT2P35908 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT2P35908 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT2P35908 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT2P35908 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT2P35908 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT2P35908 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT2P35908 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT2P35908 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT2P35908 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT2P35908 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT2P35908 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT2P35908 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT2P35908 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT2P35908 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT2P35908 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT2P35908 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT2P35908 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT2P35908 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT2P35908 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT2P35908 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT2P35908 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT2P35908 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT2P35908 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT2P35908 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT2P35908 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT2P35908 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT2P35908 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT2P35908 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT2P35908 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT2P35908 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT2P35908 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT2P35908 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT2P35908 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT2P35908 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT2P35908 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT2P35908 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT2P35908 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT2P35908 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT2P35908 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT2P35908 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT2P35908 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT2P35908 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT2P35908 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT2P35908 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT2P35908 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT2P35908 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT2P35908 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT2P35908 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT2P35908 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT2P35908 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT2P35908 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT2P35908 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT2P35908 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT2P35908 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT2P35908 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT2P35908 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT2P35908 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT2P35908 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT2P35908 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT2P35908 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT2P35908 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT2P35908 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT2P35908 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT2P35908 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT2P35908 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT2P35908 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT2P35908 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT2P35908 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT2P35908 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT2P35908 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT2P35908 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT2P35908 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT2P35908 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT2P35908 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT2P35908 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT2P35908 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT2P35908 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT2P35908 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT2P35908 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT2P35908 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT2P35908 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT2P35908 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT2P35908 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT2P35908 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT2P35908 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT2P35908 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT2P35908 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT2P35908 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT2P35908 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT2P35908 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT2P35908 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT2P35908 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT2P35908 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT2P35908 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT2P35908 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT2P35908 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT2P35908 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT2P35908 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT2P35908 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms