Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTX2P32243 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTX2P32243 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTX2P32243 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTX2P32243 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTX2P32243 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTX2P32243 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTX2P32243 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
OTX2P32243 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX2P32243 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX2P32243 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX2P32243 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX2P32243 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX2P32243 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX2P32243 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX2P32243 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX2P32243 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX2P32243 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX2P32243 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX2P32243 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX2P32243 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX2P32243 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX2P32243 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX2P32243 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX2P32243 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX2P32243 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX2P32243 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX2P32243 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX2P32243 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX2P32243 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX2P32243 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX2P32243 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX2P32243 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX2P32243 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX2P32243 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX2P32243 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
OTX2P32243 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX2P32243 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX2P32243 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX2P32243 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX2P32243 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX2P32243 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX2P32243 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX2P32243 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX2P32243 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX2P32243 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX2P32243 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX2P32243 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX2P32243 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX2P32243 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX2P32243 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX2P32243 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX2P32243 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX2P32243 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX2P32243 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX2P32243 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX2P32243 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX2P32243 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX2P32243 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX2P32243 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX2P32243 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX2P32243 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX2P32243 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX2P32243 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX2P32243 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX2P32243 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX2P32243 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX2P32243 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
OTX2P32243 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX2P32243 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX2P32243 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX2P32243 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX2P32243 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX2P32243 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX2P32243 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX2P32243 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX2P32243 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX2P32243 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX2P32243 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX2P32243 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX2P32243 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX2P32243 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX2P32243 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX2P32243 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX2P32243 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX2P32243 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX2P32243 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX2P32243 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX2P32243 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX2P32243 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX2P32243 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX2P32243 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX2P32243 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX2P32243 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX2P32243 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX2P32243 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX2P32243 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX2P32243 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX2P32243 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
OTX2P32243 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms