Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CNGA1P29973 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CNGA1P29973 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms