Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DNMT1P26358 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DNMT1P26358 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms