Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PTAFRP25105 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms