Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GADD45AP24522 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms