Protein–RNA interactions for Protein: P15531

NME1, Nucleoside diphosphate kinase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1P15531 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME1P15531 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME1P15531 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME1P15531 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME1P15531 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME1P15531 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME1P15531 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME1P15531 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME1P15531 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME1P15531 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME1P15531 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NME1P15531 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME1P15531 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME1P15531 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME1P15531 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME1P15531 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME1P15531 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME1P15531 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME1P15531 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME1P15531 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NME1P15531 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME1P15531 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME1P15531 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME1P15531 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME1P15531 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME1P15531 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME1P15531 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME1P15531 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME1P15531 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME1P15531 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NME1P15531 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME1P15531 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NME1P15531 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME1P15531 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME1P15531 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME1P15531 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME1P15531 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME1P15531 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME1P15531 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME1P15531 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME1P15531 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NME1P15531 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME1P15531 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME1P15531 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME1P15531 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME1P15531 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME1P15531 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME1P15531 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME1P15531 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME1P15531 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME1P15531 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME1P15531 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME1P15531 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NME1P15531 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME1P15531 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME1P15531 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME1P15531 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME1P15531 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NME1P15531 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NME1P15531 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME1P15531 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME1P15531 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NME1P15531 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME1P15531 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME1P15531 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME1P15531 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME1P15531 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NME1P15531 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
NME1P15531 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME1P15531 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME1P15531 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME1P15531 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME1P15531 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME1P15531 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME1P15531 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME1P15531 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME1P15531 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NME1P15531 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME1P15531 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME1P15531 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME1P15531 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME1P15531 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME1P15531 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NME1P15531 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NME1P15531 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NME1P15531 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME1P15531 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NME1P15531 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME1P15531 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME1P15531 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME1P15531 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME1P15531 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME1P15531 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME1P15531 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NME1P15531 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME1P15531 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME1P15531 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME1P15531 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME1P15531 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NME1P15531 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms