Protein–RNA interactions for Protein: P15529

CD46, Membrane cofactor protein, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD46P15529 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD46P15529 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD46P15529 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD46P15529 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD46P15529 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD46P15529 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD46P15529 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CD46P15529 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CD46P15529 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CD46P15529 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CD46P15529 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD46P15529 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD46P15529 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD46P15529 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD46P15529 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD46P15529 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD46P15529 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD46P15529 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CD46P15529 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD46P15529 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD46P15529 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD46P15529 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD46P15529 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD46P15529 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD46P15529 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD46P15529 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD46P15529 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD46P15529 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD46P15529 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD46P15529 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD46P15529 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD46P15529 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CD46P15529 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD46P15529 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD46P15529 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD46P15529 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CD46P15529 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD46P15529 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CD46P15529 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD46P15529 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD46P15529 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD46P15529 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD46P15529 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD46P15529 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD46P15529 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD46P15529 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD46P15529 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD46P15529 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD46P15529 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD46P15529 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD46P15529 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD46P15529 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD46P15529 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD46P15529 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD46P15529 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD46P15529 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CD46P15529 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD46P15529 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD46P15529 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CD46P15529 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD46P15529 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD46P15529 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD46P15529 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD46P15529 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CD46P15529 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD46P15529 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD46P15529 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD46P15529 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD46P15529 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD46P15529 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD46P15529 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD46P15529 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD46P15529 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD46P15529 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD46P15529 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD46P15529 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD46P15529 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CD46P15529 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD46P15529 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD46P15529 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CD46P15529 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD46P15529 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD46P15529 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CD46P15529 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD46P15529 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD46P15529 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD46P15529 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD46P15529 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CD46P15529 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CD46P15529 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CD46P15529 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CD46P15529 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD46P15529 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD46P15529 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD46P15529 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD46P15529 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD46P15529 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD46P15529 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD46P15529 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CD46P15529 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms