Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA1P15085 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA1P15085 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA1P15085 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA1P15085 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA1P15085 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA1P15085 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA1P15085 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA1P15085 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA1P15085 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA1P15085 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA1P15085 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CPA1P15085 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA1P15085 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA1P15085 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA1P15085 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA1P15085 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA1P15085 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA1P15085 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA1P15085 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA1P15085 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA1P15085 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA1P15085 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA1P15085 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA1P15085 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA1P15085 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA1P15085 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA1P15085 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA1P15085 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA1P15085 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA1P15085 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA1P15085 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA1P15085 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA1P15085 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA1P15085 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA1P15085 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CPA1P15085 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA1P15085 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA1P15085 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA1P15085 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA1P15085 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA1P15085 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA1P15085 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA1P15085 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA1P15085 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA1P15085 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA1P15085 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA1P15085 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA1P15085 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA1P15085 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA1P15085 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA1P15085 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA1P15085 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA1P15085 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA1P15085 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA1P15085 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA1P15085 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA1P15085 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA1P15085 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA1P15085 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CPA1P15085 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA1P15085 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA1P15085 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA1P15085 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA1P15085 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA1P15085 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA1P15085 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA1P15085 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA1P15085 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA1P15085 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA1P15085 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA1P15085 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA1P15085 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA1P15085 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA1P15085 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA1P15085 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA1P15085 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CPA1P15085 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA1P15085 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA1P15085 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA1P15085 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA1P15085 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA1P15085 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA1P15085 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA1P15085 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA1P15085 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA1P15085 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA1P15085 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA1P15085 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA1P15085 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA1P15085 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA1P15085 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA1P15085 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA1P15085 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA1P15085 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CPA1P15085 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA1P15085 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA1P15085 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA1P15085 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CPA1P15085 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms