Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM27P14373 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms