Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HLA-DOBP13765 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HLA-DOBP13765 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms