Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD8P13378 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXD8P13378 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms