Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC12□□□□□ -0.49
VPREB1P12018 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms