Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHGAP10645 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHGAP10645 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CHGAP10645 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CHGAP10645 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CHGAP10645 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CHGAP10645 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHGAP10645 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHGAP10645 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHGAP10645 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHGAP10645 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHGAP10645 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHGAP10645 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHGAP10645 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHGAP10645 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHGAP10645 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHGAP10645 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHGAP10645 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHGAP10645 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHGAP10645 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHGAP10645 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHGAP10645 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHGAP10645 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHGAP10645 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHGAP10645 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHGAP10645 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHGAP10645 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHGAP10645 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CHGAP10645 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CHGAP10645 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CHGAP10645 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHGAP10645 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHGAP10645 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHGAP10645 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHGAP10645 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHGAP10645 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHGAP10645 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHGAP10645 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHGAP10645 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHGAP10645 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHGAP10645 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHGAP10645 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHGAP10645 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHGAP10645 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHGAP10645 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CHGAP10645 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHGAP10645 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CHGAP10645 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHGAP10645 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CHGAP10645 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHGAP10645 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHGAP10645 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHGAP10645 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHGAP10645 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHGAP10645 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHGAP10645 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHGAP10645 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHGAP10645 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHGAP10645 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHGAP10645 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHGAP10645 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHGAP10645 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHGAP10645 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHGAP10645 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHGAP10645 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHGAP10645 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHGAP10645 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHGAP10645 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHGAP10645 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHGAP10645 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHGAP10645 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CHGAP10645 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHGAP10645 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHGAP10645 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHGAP10645 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHGAP10645 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHGAP10645 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CHGAP10645 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CHGAP10645 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CHGAP10645 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHGAP10645 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHGAP10645 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CHGAP10645 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHGAP10645 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHGAP10645 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHGAP10645 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHGAP10645 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHGAP10645 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHGAP10645 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHGAP10645 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHGAP10645 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHGAP10645 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHGAP10645 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHGAP10645 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHGAP10645 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHGAP10645 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CHGAP10645 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHGAP10645 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHGAP10645 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHGAP10645 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms