Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PTPRFP10586 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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