Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
U2AF1L5P0DN76 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
U2AF1L5P0DN76 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms