Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TMIGD3P0DMS9 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms