Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SAA2P0DJI9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms