Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RD3LP0DJH9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms