Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLK3P07288 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLK3P07288 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLK3P07288 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLK3P07288 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLK3P07288 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLK3P07288 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLK3P07288 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLK3P07288 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLK3P07288 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLK3P07288 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLK3P07288 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLK3P07288 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLK3P07288 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLK3P07288 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLK3P07288 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLK3P07288 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLK3P07288 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLK3P07288 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KLK3P07288 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLK3P07288 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLK3P07288 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLK3P07288 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KLK3P07288 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLK3P07288 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLK3P07288 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLK3P07288 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLK3P07288 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLK3P07288 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
KLK3P07288 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLK3P07288 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLK3P07288 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLK3P07288 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLK3P07288 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
KLK3P07288 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLK3P07288 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLK3P07288 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLK3P07288 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLK3P07288 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLK3P07288 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLK3P07288 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLK3P07288 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLK3P07288 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLK3P07288 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLK3P07288 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLK3P07288 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
KLK3P07288 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
KLK3P07288 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLK3P07288 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLK3P07288 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLK3P07288 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLK3P07288 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLK3P07288 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLK3P07288 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLK3P07288 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KLK3P07288 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLK3P07288 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLK3P07288 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLK3P07288 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLK3P07288 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLK3P07288 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLK3P07288 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KLK3P07288 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
KLK3P07288 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLK3P07288 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLK3P07288 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLK3P07288 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLK3P07288 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLK3P07288 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLK3P07288 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLK3P07288 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
KLK3P07288 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLK3P07288 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLK3P07288 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLK3P07288 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLK3P07288 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLK3P07288 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLK3P07288 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLK3P07288 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLK3P07288 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLK3P07288 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLK3P07288 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLK3P07288 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLK3P07288 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLK3P07288 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLK3P07288 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLK3P07288 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLK3P07288 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLK3P07288 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLK3P07288 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLK3P07288 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLK3P07288 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLK3P07288 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLK3P07288 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLK3P07288 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLK3P07288 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLK3P07288 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLK3P07288 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLK3P07288 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
KLK3P07288 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms