Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPBP07199 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPBP07199 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPBP07199 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPBP07199 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPBP07199 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CENPBP07199 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPBP07199 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPBP07199 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPBP07199 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPBP07199 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPBP07199 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPBP07199 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPBP07199 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPBP07199 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPBP07199 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPBP07199 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPBP07199 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPBP07199 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPBP07199 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPBP07199 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPBP07199 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPBP07199 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPBP07199 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPBP07199 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPBP07199 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPBP07199 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPBP07199 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CENPBP07199 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPBP07199 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPBP07199 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPBP07199 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPBP07199 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPBP07199 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPBP07199 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPBP07199 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPBP07199 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPBP07199 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPBP07199 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPBP07199 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPBP07199 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPBP07199 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPBP07199 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CENPBP07199 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPBP07199 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPBP07199 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPBP07199 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPBP07199 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPBP07199 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPBP07199 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPBP07199 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPBP07199 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPBP07199 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPBP07199 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPBP07199 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPBP07199 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPBP07199 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CENPBP07199 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPBP07199 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPBP07199 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPBP07199 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPBP07199 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPBP07199 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPBP07199 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPBP07199 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPBP07199 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPBP07199 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPBP07199 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPBP07199 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPBP07199 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPBP07199 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPBP07199 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CENPBP07199 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CENPBP07199 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CENPBP07199 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPBP07199 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPBP07199 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPBP07199 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPBP07199 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPBP07199 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPBP07199 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPBP07199 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPBP07199 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPBP07199 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPBP07199 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPBP07199 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPBP07199 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPBP07199 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPBP07199 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPBP07199 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPBP07199 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPBP07199 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPBP07199 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPBP07199 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPBP07199 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPBP07199 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPBP07199 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPBP07199 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPBP07199 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CENPBP07199 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms