Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEFMP07197 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEFMP07197 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
NEFMP07197 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEFMP07197 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEFMP07197 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEFMP07197 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEFMP07197 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEFMP07197 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEFMP07197 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEFMP07197 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEFMP07197 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEFMP07197 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEFMP07197 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEFMP07197 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEFMP07197 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEFMP07197 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEFMP07197 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEFMP07197 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEFMP07197 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEFMP07197 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEFMP07197 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEFMP07197 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFMP07197 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFMP07197 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFMP07197 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFMP07197 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFMP07197 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFMP07197 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFMP07197 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFMP07197 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFMP07197 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFMP07197 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFMP07197 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFMP07197 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFMP07197 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFMP07197 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFMP07197 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFMP07197 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFMP07197 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFMP07197 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFMP07197 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFMP07197 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFMP07197 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEFMP07197 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEFMP07197 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEFMP07197 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEFMP07197 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEFMP07197 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEFMP07197 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEFMP07197 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEFMP07197 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEFMP07197 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NEFMP07197 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEFMP07197 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
NEFMP07197 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEFMP07197 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEFMP07197 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEFMP07197 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEFMP07197 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEFMP07197 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEFMP07197 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEFMP07197 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEFMP07197 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEFMP07197 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEFMP07197 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEFMP07197 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEFMP07197 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEFMP07197 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NEFMP07197 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NEFMP07197 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEFMP07197 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEFMP07197 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEFMP07197 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEFMP07197 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEFMP07197 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEFMP07197 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEFMP07197 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEFMP07197 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
NEFMP07197 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFMP07197 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFMP07197 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFMP07197 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFMP07197 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFMP07197 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFMP07197 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFMP07197 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFMP07197 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFMP07197 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFMP07197 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFMP07197 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFMP07197 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFMP07197 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFMP07197 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFMP07197 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFMP07197 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFMP07197 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFMP07197 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFMP07197 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
NEFMP07197 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms