Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDHBP07195 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDHBP07195 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LDHBP07195 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDHBP07195 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LDHBP07195 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDHBP07195 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDHBP07195 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDHBP07195 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDHBP07195 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDHBP07195 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDHBP07195 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDHBP07195 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDHBP07195 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDHBP07195 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDHBP07195 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDHBP07195 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDHBP07195 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDHBP07195 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LDHBP07195 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDHBP07195 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDHBP07195 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDHBP07195 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LDHBP07195 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LDHBP07195 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LDHBP07195 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LDHBP07195 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LDHBP07195 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LDHBP07195 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDHBP07195 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDHBP07195 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDHBP07195 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDHBP07195 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LDHBP07195 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDHBP07195 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDHBP07195 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDHBP07195 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDHBP07195 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDHBP07195 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDHBP07195 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDHBP07195 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDHBP07195 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDHBP07195 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDHBP07195 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDHBP07195 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LDHBP07195 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDHBP07195 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDHBP07195 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDHBP07195 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDHBP07195 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDHBP07195 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDHBP07195 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LDHBP07195 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LDHBP07195 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDHBP07195 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDHBP07195 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDHBP07195 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDHBP07195 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDHBP07195 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDHBP07195 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDHBP07195 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDHBP07195 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDHBP07195 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDHBP07195 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDHBP07195 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDHBP07195 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDHBP07195 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LDHBP07195 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDHBP07195 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDHBP07195 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LDHBP07195 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDHBP07195 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDHBP07195 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDHBP07195 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDHBP07195 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDHBP07195 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDHBP07195 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDHBP07195 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDHBP07195 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDHBP07195 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LDHBP07195 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDHBP07195 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDHBP07195 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDHBP07195 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDHBP07195 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LDHBP07195 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDHBP07195 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDHBP07195 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDHBP07195 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDHBP07195 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDHBP07195 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDHBP07195 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDHBP07195 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDHBP07195 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDHBP07195 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDHBP07195 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDHBP07195 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDHBP07195 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDHBP07195 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDHBP07195 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms