Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
APOA1P02647 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOA1P02647 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOA1P02647 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOA1P02647 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOA1P02647 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOA1P02647 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOA1P02647 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOA1P02647 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOA1P02647 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOA1P02647 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOA1P02647 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOA1P02647 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOA1P02647 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOA1P02647 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOA1P02647 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOA1P02647 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOA1P02647 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOA1P02647 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOA1P02647 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOA1P02647 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOA1P02647 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
APOA1P02647 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOA1P02647 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOA1P02647 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOA1P02647 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOA1P02647 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOA1P02647 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOA1P02647 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOA1P02647 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
APOA1P02647 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
APOA1P02647 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
APOA1P02647 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOA1P02647 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOA1P02647 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOA1P02647 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOA1P02647 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOA1P02647 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOA1P02647 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOA1P02647 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOA1P02647 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOA1P02647 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOA1P02647 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOA1P02647 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOA1P02647 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOA1P02647 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOA1P02647 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOA1P02647 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
APOA1P02647 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOA1P02647 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOA1P02647 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOA1P02647 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
APOA1P02647 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOA1P02647 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOA1P02647 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOA1P02647 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOA1P02647 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOA1P02647 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOA1P02647 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOA1P02647 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOA1P02647 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOA1P02647 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOA1P02647 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOA1P02647 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOA1P02647 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOA1P02647 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOA1P02647 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOA1P02647 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOA1P02647 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOA1P02647 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOA1P02647 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOA1P02647 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOA1P02647 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
APOA1P02647 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
APOA1P02647 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOA1P02647 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOA1P02647 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOA1P02647 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOA1P02647 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOA1P02647 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOA1P02647 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOA1P02647 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOA1P02647 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
APOA1P02647 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOA1P02647 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
APOA1P02647 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOA1P02647 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOA1P02647 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
APOA1P02647 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
APOA1P02647 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOA1P02647 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOA1P02647 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
APOA1P02647 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOA1P02647 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOA1P02647 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOA1P02647 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOA1P02647 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOA1P02647 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOA1P02647 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
APOA1P02647 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms