Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HLA-HP01893 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms