Protein–RNA interactions for Protein: P01891

HLA-A, HLA class I histocompatibility antigen, A-68 alpha chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-AP01891 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HLA-AP01891 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms