Protein–RNA interactions for Protein: O95428

PAPLN, Papilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLNO95428 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PAPLNO95428 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PAPLNO95428 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PAPLNO95428 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAPLNO95428 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAPLNO95428 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAPLNO95428 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAPLNO95428 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAPLNO95428 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAPLNO95428 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAPLNO95428 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAPLNO95428 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAPLNO95428 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAPLNO95428 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PAPLNO95428 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms