Protein–RNA interactions for Protein: O60841

EIF5B, Eukaryotic translation initiation factor 5B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF5BO60841 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF5BO60841 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms