Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KIAA0556O60303 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KIAA0556O60303 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms