Protein–RNA interactions for Protein: O60237

PPP1R12B, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 12B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R12BO60237 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP1R12BO60237 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPP1R12BO60237 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPP1R12BO60237 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPP1R12BO60237 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R12BO60237 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R12BO60237 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R12BO60237 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R12BO60237 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R12BO60237 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R12BO60237 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R12BO60237 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R12BO60237 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R12BO60237 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R12BO60237 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R12BO60237 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R12BO60237 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R12BO60237 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R12BO60237 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R12BO60237 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R12BO60237 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R12BO60237 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R12BO60237 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R12BO60237 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R12BO60237 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R12BO60237 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R12BO60237 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R12BO60237 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP1R12BO60237 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R12BO60237 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R12BO60237 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R12BO60237 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R12BO60237 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R12BO60237 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R12BO60237 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R12BO60237 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R12BO60237 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPP1R12BO60237 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms