Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SCO2O43819 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
SCO2O43819 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCO2O43819 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCO2O43819 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCO2O43819 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCO2O43819 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCO2O43819 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCO2O43819 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCO2O43819 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCO2O43819 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCO2O43819 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCO2O43819 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCO2O43819 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SCO2O43819 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCO2O43819 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCO2O43819 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCO2O43819 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCO2O43819 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCO2O43819 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCO2O43819 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCO2O43819 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCO2O43819 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCO2O43819 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCO2O43819 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCO2O43819 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCO2O43819 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCO2O43819 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCO2O43819 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCO2O43819 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCO2O43819 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCO2O43819 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCO2O43819 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCO2O43819 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCO2O43819 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCO2O43819 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCO2O43819 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCO2O43819 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCO2O43819 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCO2O43819 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCO2O43819 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCO2O43819 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCO2O43819 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCO2O43819 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCO2O43819 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCO2O43819 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCO2O43819 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCO2O43819 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCO2O43819 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCO2O43819 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCO2O43819 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCO2O43819 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCO2O43819 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCO2O43819 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCO2O43819 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCO2O43819 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCO2O43819 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCO2O43819 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCO2O43819 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCO2O43819 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCO2O43819 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCO2O43819 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCO2O43819 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SCO2O43819 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SCO2O43819 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCO2O43819 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCO2O43819 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCO2O43819 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCO2O43819 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCO2O43819 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCO2O43819 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCO2O43819 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCO2O43819 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCO2O43819 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCO2O43819 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCO2O43819 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCO2O43819 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCO2O43819 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCO2O43819 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SCO2O43819 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCO2O43819 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCO2O43819 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCO2O43819 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SCO2O43819 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCO2O43819 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCO2O43819 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCO2O43819 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCO2O43819 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCO2O43819 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCO2O43819 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCO2O43819 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCO2O43819 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCO2O43819 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCO2O43819 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCO2O43819 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCO2O43819 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SCO2O43819 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCO2O43819 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCO2O43819 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SCO2O43819 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms