Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HOXA3O43365 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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HOXA3O43365 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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HOXA3O43365 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
HOXA3O43365 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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HOXA3O43365 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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HOXA3O43365 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
HOXA3O43365 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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