Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SIAH2O43255 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SIAH2O43255 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms