Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSH5O43196 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSH5O43196 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSH5O43196 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSH5O43196 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MSH5O43196 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSH5O43196 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSH5O43196 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSH5O43196 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSH5O43196 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSH5O43196 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSH5O43196 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSH5O43196 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSH5O43196 TMEM126A-201ENST00000304511 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSH5O43196 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSH5O43196 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSH5O43196 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MSH5O43196 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MSH5O43196 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSH5O43196 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSH5O43196 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MSH5O43196 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MSH5O43196 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSH5O43196 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSH5O43196 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSH5O43196 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSH5O43196 AC131649.1-201ENST00000569215 1313 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MSH5O43196 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSH5O43196 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSH5O43196 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSH5O43196 MAPK10-379ENST00000642013 1385 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MSH5O43196 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MSH5O43196 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSH5O43196 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSH5O43196 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSH5O43196 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSH5O43196 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSH5O43196 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSH5O43196 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSH5O43196 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSH5O43196 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSH5O43196 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSH5O43196 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSH5O43196 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSH5O43196 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSH5O43196 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MSH5O43196 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSH5O43196 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSH5O43196 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MSH5O43196 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MSH5O43196 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSH5O43196 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MSH5O43196 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSH5O43196 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSH5O43196 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSH5O43196 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSH5O43196 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSH5O43196 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MSH5O43196 GBP1P1-201ENST00000394662 1740 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MSH5O43196 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSH5O43196 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSH5O43196 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSH5O43196 TCEAL8-201ENST00000360000 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSH5O43196 AC246787.1-201ENST00000392301 627 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MSH5O43196 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MSH5O43196 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSH5O43196 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MSH5O43196 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MSH5O43196 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSH5O43196 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSH5O43196 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSH5O43196 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSH5O43196 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSH5O43196 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSH5O43196 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSH5O43196 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSH5O43196 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSH5O43196 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSH5O43196 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSH5O43196 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSH5O43196 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSH5O43196 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MSH5O43196 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSH5O43196 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSH5O43196 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSH5O43196 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSH5O43196 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSH5O43196 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MSH5O43196 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSH5O43196 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSH5O43196 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSH5O43196 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSH5O43196 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSH5O43196 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MSH5O43196 HRAT17-202ENST00000451962 687 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSH5O43196 AP001528.1-201ENST00000499504 1223 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSH5O43196 SPINK1-203ENST00000510027 1188 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSH5O43196 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MSH5O43196 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MSH5O43196 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms