Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SETD1AO15047 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms