Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASKO14936 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASKO14936 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASKO14936 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASKO14936 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CASKO14936 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASKO14936 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASKO14936 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASKO14936 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASKO14936 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASKO14936 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASKO14936 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASKO14936 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASKO14936 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASKO14936 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASKO14936 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASKO14936 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASKO14936 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASKO14936 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASKO14936 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASKO14936 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CASKO14936 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASKO14936 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASKO14936 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASKO14936 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASKO14936 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASKO14936 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASKO14936 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASKO14936 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASKO14936 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASKO14936 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASKO14936 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASKO14936 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CASKO14936 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASKO14936 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASKO14936 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASKO14936 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASKO14936 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASKO14936 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASKO14936 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASKO14936 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CASKO14936 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CASKO14936 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASKO14936 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CASKO14936 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASKO14936 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASKO14936 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASKO14936 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASKO14936 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASKO14936 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASKO14936 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASKO14936 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASKO14936 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASKO14936 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASKO14936 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CASKO14936 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASKO14936 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASKO14936 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASKO14936 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASKO14936 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASKO14936 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CASKO14936 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASKO14936 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASKO14936 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASKO14936 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASKO14936 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASKO14936 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASKO14936 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASKO14936 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASKO14936 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASKO14936 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASKO14936 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASKO14936 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CASKO14936 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASKO14936 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASKO14936 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASKO14936 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASKO14936 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASKO14936 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASKO14936 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASKO14936 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASKO14936 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASKO14936 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASKO14936 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CASKO14936 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASKO14936 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASKO14936 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASKO14936 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASKO14936 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASKO14936 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASKO14936 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASKO14936 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASKO14936 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASKO14936 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASKO14936 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASKO14936 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASKO14936 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASKO14936 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASKO14936 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CASKO14936 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms