Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NFKBIEO00221 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NFKBIEO00221 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms