Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SNAP23O00161 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SNAP23O00161 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms