Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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