Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
E9PCH4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
E9PCH4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
E9PCH4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
E9PCH4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
E9PCH4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
E9PCH4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
E9PCH4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
E9PCH4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
E9PCH4 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
E9PCH4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
E9PCH4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
E9PCH4 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
E9PCH4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
E9PCH4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
E9PCH4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
E9PCH4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
E9PCH4 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
E9PCH4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
E9PCH4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
E9PCH4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
E9PCH4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
E9PCH4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
E9PCH4 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
E9PCH4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
E9PCH4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
E9PCH4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
E9PCH4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
E9PCH4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
E9PCH4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
E9PCH4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
E9PCH4 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
E9PCH4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
E9PCH4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
E9PCH4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
E9PCH4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
E9PCH4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
E9PCH4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
E9PCH4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
E9PCH4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
E9PCH4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
E9PCH4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
E9PCH4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
E9PCH4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
E9PCH4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
E9PCH4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
E9PCH4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
E9PCH4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.91
E9PCH4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.91
E9PCH4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
E9PCH4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
E9PCH4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
E9PCH4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
E9PCH4 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
E9PCH4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
E9PCH4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
E9PCH4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
E9PCH4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
E9PCH4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
E9PCH4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
E9PCH4 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
E9PCH4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
E9PCH4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
E9PCH4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
E9PCH4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
E9PCH4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
E9PCH4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
E9PCH4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
E9PCH4 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
E9PCH4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
E9PCH4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
E9PCH4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
E9PCH4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
E9PCH4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
E9PCH4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
E9PCH4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
E9PCH4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
E9PCH4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
E9PCH4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
E9PCH4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
E9PCH4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
E9PCH4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
E9PCH4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
E9PCH4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
E9PCH4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
E9PCH4 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
E9PCH4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
E9PCH4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
E9PCH4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
E9PCH4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
E9PCH4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
E9PCH4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
E9PCH4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
E9PCH4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
E9PCH4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
E9PCH4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
E9PCH4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
E9PCH4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
E9PCH4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
E9PCH4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms